Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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TRAF1Q13077 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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