Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna2d3Q9Z1L5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms