Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNH4Q9UQ05 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNH4Q9UQ05 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms