Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpc6Q9R087 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gpc6Q9R087 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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