Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcnip3Q9QXT8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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