Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alyref2Q9JJW6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms