Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sphk2Q9JIA7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sphk2Q9JIA7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms