Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms