Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab3bQ9CZT8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab3bQ9CZT8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms