Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shmt2Q9CZN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms