Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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