Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ly6kQ9CWP4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms