Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhfpl3Q9CTN8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhfpl3Q9CTN8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms