Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms