Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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