Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPNS2Q96L46 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPNS2Q96L46 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms