Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms