Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan10Q8VCF5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan10Q8VCF5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tspan10Q8VCF5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tspan10Q8VCF5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tspan10Q8VCF5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan10Q8VCF5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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