Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms