Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ercc8Q8CFD5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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