Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3Q8BRE0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3Q8BRE0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3Q8BRE0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rd3Q8BRE0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rd3Q8BRE0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rd3Q8BRE0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rd3Q8BRE0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms