Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCSAPQ6IQ19 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCSAPQ6IQ19 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms