Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UST5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UST5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UST5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3UST5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3UST5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UST5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UST5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms