Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Fam117bQ3U3E2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Fam117bQ3U3E2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam117bQ3U3E2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms