Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RelaQ04207 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms