Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms