Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga4Q00651 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms