Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp25P57080 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp25P57080 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms