Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abcd3P55096 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abcd3P55096 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd3P55096 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd3P55096 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd3P55096 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd3P55096 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd3P55096 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms