Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Faf1P54731 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Faf1P54731 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Faf1P54731 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.5 ms