Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GdnfP48540 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GdnfP48540 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms