Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1aP36536 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms