Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Apoc1P34928 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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