Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra3P26049 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms