Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh2P15116 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh2P15116 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms