Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AvilO88398 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AvilO88398 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AvilO88398 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AvilO88398 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AvilO88398 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms