Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms