Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hps1O08983 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps1O08983 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms