Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20828J3KMI7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20828J3KMI7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20828J3KMI7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm20828J3KMI7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20828J3KMI7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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