Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms