Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms