Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms