Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ssxb8B1AY40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssxb8B1AY40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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