Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm11127A7VMS2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm11127A7VMS2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm11127A7VMS2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm11127A7VMS2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm11127A7VMS2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm11127A7VMS2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm11127A7VMS2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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