Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LRIG3Q6UXM1 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms