Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CCDC142Q17RM4 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CCDC142Q17RM4 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CCDC142Q17RM4 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CCDC142Q17RM4 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CCDC142Q17RM4 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CCDC142Q17RM4 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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