Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VPS72Q15906 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms