Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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