Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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