Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NME3Q13232 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms